仁增沽滇〈1337-1408〉是蓮花生大士化身的108位岩取大師之一，有一天仁增沽滇向其心子桑達札西多傑開示無常，桑達札西多傑體會到上師即將離開人世，因此祈求上師長久住世。仁增沽滇告訴他：「你不必傷心，我走了後，會來到你到膝下〈化身為你的而子〉。」自此仁增沽滇的法脈，即以桑達札西多傑的血脈代代相傳。桑達札西多傑之子─仁增阿更旺波〈仁增沽滇的轉世〉得到了父親的一切口訣及灌頂，並由止貢法王嘉旺仁欽彭措為其剃度。之後與父親共同建立了「多傑札寺」，在藏東地區廣傳寧瑪巴北岩傳教法，此一法教的傳播，使各地都得到了和諧及繁榮的加持，在西藏建立了聞名的寧瑪巴多傑札教派，對寧瑪巴傳承有深遠的影響。仁增阿更旺波並曾為第五世達賴灌頂、剃度。

札噶仁波切出生於1954年的藏曆8月15日，為桑達札西多傑的後代〈亦是法脈傳承〉，其父親是一位偉大的瑜伽士，母親為一真實智慧空行母的化現，已斷盡了一切過失，她敘述其懷孕之時，即有特別的徵兆顯現；在夢中示現了白海螺，當仁波切出生後，則給予這孩子特別的厚愛。

當仁波切四歲時，怙主第七世的洛竹卡恰多傑仁波切，認出為其上師圖登索都塔欽的轉世，並為其舉行剃度及皈依三寶的儀式。由於當時西藏在政治及社會上不安定，故無機會能讓仁波切坐床及接受法教，但基於宿世天性，仁波切自小就不願從事不善的行為，當他見到人們貧窮、疾病及痛苦時，即開始哭泣。

13歲時，開始學習藏文，且在讀寫方面，非常快速超越了其他同學，18歲開始學藏醫，共花了八年的時間，此外也加強藏文程度，並教導同儕。24歲時，嬸嬸的死亡使他升起了強烈的認知，仁波切不願再過一般仁的生活，二年之後，至拉薩朝聖，並參觀世尊釋迦牟尼佛像；在即將抵達目的地時，仁波切觸碰著額頭，並從內心裏深切的祈請佛陀的加持，願他能解脫世俗的束縛。當晚他做了一個吉祥的夢，夢見在自家的屋頂上，生起了二具尊勝法幢。

之後至止貢梯寺拜見滇真尼瑪仁波切，滇真尼瑪仁波切告訴札噶仁波切，這夢境之顯示是非常殊聖的，表示札噶仁波切已受到三寶的加持，對於他的佛行事業，將有很大的幫助。由於此一因素，札噶仁波切開始精進的修行，在拉薩依止堪布拉滇，即蔣揚欽哲卻吉羅卓的弟子，學習「薩迦格言」與「遠離四種執著」的教法。並依止噶千仁波切，學習止貢噶舉一切的教法，「大手印五支道」、「廣深大圓滿」及許多甚深精湛的教法。

在1979年返回東藏，在洛美耶寺進行閉關，修習「廣深大圓滿」。又至德格縣，依止竹千噶瑪諾布仁波切，並在該處得到「岡波巴教言」的灌頂與修法及「大手印本質」的教授。

在1984年，依止噶陀大成就者堪布穆色仁波切受比丘戒，完成了50萬遍遍知吉美林巴的「龍欽心髓」四加行，之後堪布穆色仁波切給予了「大圓滿空觀」的詳細指導及教授，當天札噶仁波切的覺性光明自然升起；堪布穆色坐在其後，要札噶仁波切依照次第觀修，而這本覺心性的顯現，使仁波切安住於空寂的狀態中，如同啞巴吃甘蔗一般，無法用言語表達，仁波切的覺受是無法形容的！

堪布穆色用溫和的眼神看著札噶仁波切並說道：「你的根器需修習大圓滿，我乃你的根本上師，你現在已經契入了大圓滿境。就像你騎了一匹有著鐵蹄的馬，騎了好幾天都找不到通往目的地的道路，現在你已經找到了，這就是成佛之道，此生證悟之路，所以用一年的時間跟著我好好學習吧！」札噶仁波切深深感受到上師的慈悲與加持，就如同佛陀一樣無二無別，而長久以來累積的所有困惑，居然在一剎那間完全被清除了，然後他哭了起來。

接下來的七年都跟隨著堪布穆色學習，這段期間修習「且卻」〈立斷〉、「委噶」〈頓超〉、「堪布雅瓊教言」、「龍欽七寶藏」、「米滂教言」、「三本心論」、「巴楚仁波切教言」、「伏魔法」及「大寶伏藏」的教法。

此外，在仁波切36歲的時候，及1990年，接受了許多上師及堪布的灌頂與傳承之後，至晉美彭措法王處，停留了100天；得到了其法教並進行閉關。這些珍貴的法教及灌頂包括了「空行心髓」、「明力四灌頂」和法王在閉關時親自寫的「且卻」法門。在接受「且卻」的教法之後，晉美彭措法王對札噶仁波切說：「我相信這法教不會讓你失望，我有兩名弟子，在接受完此一教授之後，都已經證得了虹光身。」

懷著對上師堅定不移的信念，並遵循其教誨，法王希望仁波切能勸導眾生，佈施建造佛塔及持誦阿彌陀佛的心咒，故仁波切返回家鄉之後，即廣為宣說此二者的功德，利益了許許多多的眾生。很多人都圓滿了阿彌陀佛心咒十萬遍及百萬遍的念誦。

同時仁波切也從阿帝仁波切，康楚仁波切得到了「寧瑪教義」的口傳，從桑傑滇真仁波切處，得到種種灌頂及甚深的教導。

兩年之後〈1992年〉仁波切前往昌都，為堪千噶瑪的邀請，前往塔卻貢寺給予僧尼口傳，傳授「龍欽七寶藏」，這一次來受法的僧尼超過了一百位。也傳授「巴楚仁波切教言」及「密勒日巴道歌」，也因應大眾的請求，給予了堪布雅瓊的教法。之後札噶仁波切被寺裡的祖古及堪布稱為「嚨喇嘛」，即口傳上師之意，因為札噶仁波切具足了一切教法的口傳。

而後仁波切返回洛美耶寺閉關一個月，接受圖登甲疊梭滇南架的「瑪爾巴」、「密勒日巴」，「岡波巴」的教法與灌頂，和「康楚教言」及「那洛六法」。一年後仁波切前往閉關，接著又至西藏止貢梯寺，接受了「止貢大遷識法」的教授，依止洛本滇真尼瑪，學習「大手印五支道」、「那洛六法」等教法，之後閉關達一年的時間。之後前往境內各聖地閉關，並與各地建立了良好的互動聯繫，再止貢達拉揚滇岡寺傳授「龍欽七寶藏」，給予修行者「解脫經」的教授，並且每日實修。

在1993年12月，札噶仁波切經由尼泊爾到印度強久林，依止止貢澈贊法王，得到了「勝樂輪金剛」的灌頂，「大手印五支道」及「三光疏」的教授，法王特別給予仁波切大手印「信力命輪」的教授，法王並請仁波切擔任洛美耶寺的閉關老師，仁波切也得到了「吉天頌恭全集」、「慈氏五論」的教導，之後返回洛美耶寺，向僧尼傳授了「密勒日巴道歌」、「恰美言教」、「蓮花生大士本生傳記」。

1994年仁波切赴拉不企雪山閉關1年，此聖地曾為密勒日巴閉關修行的地方。當仁波切回到印度時，遇見了竹巴噶舉的堪徹上師，學習竹巴噶舉傳承的「那洛六法」、「大手印」及「帕摩竹巴」、「知三世」的問法錄。

仁波切一直以來都是信心堅固，並刻苦持續教法的修持，從未去思維任何世俗上的財富及受用。1998年，朗欽加布仁波切確認札噶仁波切在大圓滿上的見地與成就，希望盡可能的給予學生教導，並尊稱為〝洛本仁波切〞〈即尊貴上師之意〉，以嘉勉他在修行上的精進及卓越的成就。

札噶仁波切在佛行事業上的努力，是眾所皆知的，仁波切的家鄉是個很偏遠的地方，大多數的居民都不認識字，所以仁波切興辦學校供給成人及小孩教育；同時也整修洛美耶寺，並願佛陀的教法飄揚至每一個角落。